MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 17463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007613	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007613	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007613	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007613	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007613	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007613	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007613	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007613	T	7	7	302	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007613	AAC	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007613	T	6	6	5069	5074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007613	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007613	AAC	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007613	CGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007613	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007613	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007613	A	7	7	6494	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007613	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007613	GCC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007613	AGA	2	6	7606	7611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007613	ATC	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007613	CGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007613	TGCCGC	2	12	7883	7894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007613	CGC	2	6	7979	7984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007613	GCC	2	6	7985	7990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007613	GCCA	2	8	8002	8009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007613	TTA	2	6	8059	8064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007613	CAG	2	6	8162	8167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007613	AAT	2	6	8183	8188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007613	CG	3	6	8329	8334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007613	CGG	2	6	8476	8481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007613	CG	3	6	8521	8526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007613	CAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007613	TAA	2	6	8710	8715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007613	A	6	6	8721	8726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007613	GCAT	2	8	8731	8738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007613	AAG	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007613	TA	3	6	8800	8805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007613	GGCG	2	8	8862	8869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007613	CGG	2	6	8926	8931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007613	CGT	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007613	ATC	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007613	CTGT	2	8	10015	10022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007613	C	6	6	10675	10680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_007613	G	6	6	10685	10690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007613	ATC	3	9	11282	11290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007613	GAAT	2	8	11291	11298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007613	AAT	2	6	11304	11309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007613	ATA	2	6	11345	11350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007613	GAAAAT	2	12	11388	11399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007613	GTC	2	6	12160	12165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007613	CAGT	2	8	12272	12279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007613	CTT	2	6	12288	12293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007613	GGC	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007613	TAG	2	6	13178	13183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007613	AGTG	2	8	13192	13199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007613	A	7	7	13207	13213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007613	ATG	2	6	13269	13274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007613	AT	3	6	13280	13285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007613	A	6	6	15299	15304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007613	CCG	2	6	16528	16533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007613	GACA	2	8	16822	16829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007613	CGC	2	6	16842	16847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007613	TAT	2	6	16848	16853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007613	CT	3	6	16858	16863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007613	T	6	6	16924	16929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007613	ATT	2	6	16939	16944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007613	ATT	2	6	16971	16976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007613	GAC	2	6	16977	16982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007613	ATT	2	6	16990	16995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007613	ATTA	2	8	17037	17044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007613	TAAT	2	8	17055	17062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007613	A	6	6	17179	17184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007613	ATT	2	6	17188	17193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007613	GAT	2	6	17218	17223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007613	GA	3	6	18497	18502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007613	GGA	2	6	19435	19440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007613	ATT	2	6	19481	19486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007613	ATT	2	6	19501	19506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007613	AATA	2	8	19525	19532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007613	CTTC	2	8	19547	19554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007613	AGT	2	6	19572	19577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007613	CAT	2	6	19611	19616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007613	T	6	6	19670	19675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007613	ATG	2	6	19786	19791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007613	ATT	2	6	19807	19812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007613	GT	3	6	20820	20825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007613	TC	3	6	20826	20831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007613	CAT	2	6	20835	20840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007613	AGC	2	6	20844	20849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007613	A	7	7	20856	20862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007613	CTT	2	6	21234	21239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007613	CGC	2	6	25819	25824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007613	AGC	2	6	27270	27275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007613	T	6	6	27312	27317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007613	TCAT	2	8	28269	28276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007613	TCCC	2	8	28299	28306	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_007613	TGGC	2	8	28340	28347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007613	ATTTA	2	10	29266	29275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007613	TCT	2	6	29364	29369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007613	TGT	2	6	29375	29380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007613	TCT	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007613	CATG	2	8	29508	29515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007613	ATA	2	6	29525	29530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007613	A	6	6	29532	29537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007613	GCC	2	6	29580	29585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007613	TCG	2	6	29599	29604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007613	TCA	2	6	29630	29635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007613	AGTG	2	8	29658	29665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007613	TGA	2	6	34135	34140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007613	T	8	8	34147	34154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007613	G	6	6	34175	34180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007613	ATT	2	6	36233	36238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007613	AT	3	6	36256	36261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007613	TGTT	2	8	38728	38735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007613	GCG	2	6	38752	38757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007613	GA	3	6	38766	38771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007613	CAG	2	6	38784	38789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007613	CAT	2	6	38809	38814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007613	CGA	2	6	38827	38832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007613	T	8	8	38863	38870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007613	CAA	2	6	43810	43815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007613	CAT	2	6	46190	46195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007613	GTG	2	6	46280	46285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007613	GT	3	6	46405	46410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007613	ACC	2	6	50972	50977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007613	GTG	2	6	50999	51004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007613	T	7	7	51090	51096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007613	A	6	6	53465	53470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007613	TCCA	2	8	57642	57649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007613	A	7	7	57649	57655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007613	AG	3	6	57674	57679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007613	AAT	2	6	57760	57765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007613	TAA	2	6	57853	57858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007613	TCT	2	6	57942	57947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007613	CGC	2	6	59792	59797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007613	A	6	6	63075	63080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007613	TAGTG	2	10	63198	63207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007613	ATTTT	2	10	64914	64923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007613	AAT	2	6	64938	64943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007613	AGG	2	6	64960	64965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007613	CAT	2	6	65112	65117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007613	CAG	2	6	65150	65155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007613	CTG	2	6	65163	65168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007613	T	8	8	65170	65177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007613	CGC	2	6	65183	65188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007613	A	7	7	71061	71067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007613	T	6	6	71086	71091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007613	TGC	2	6	71321	71326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_007613	T	6	6	115971	115976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007613	TTA	2	6	116003	116008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007613	TGT	2	6	116034	116039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_007613	GGT	3	9	116088	116096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007613	GCA	2	6	116134	116139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_007613	TAAG	2	8	116174	116181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007613	CGC	2	6	116208	116213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_007613	GAC	2	6	116226	116231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_007613	CCG	2	6	116240	116245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_007613	AT	3	6	116253	116258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007613	A	6	6	117723	117728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007613	CGC	2	6	117740	117745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_007613	T	7	7	117746	117752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_007613	T	6	6	119812	119817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_007613	T	6	6	119825	119830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_007613	CGT	2	6	119846	119851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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403	NC_007613	TAT	2	6	143374	143379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_007613	A	6	6	146312	146317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_007613	TG	3	6	146938	146943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_007613	GGTT	2	8	150754	150761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
413	NC_007613	TCTCCC	2	12	150763	150774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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415	NC_007613	TCACCC	2	12	150814	150825	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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417	NC_007613	TCT	3	9	150880	150888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_007613	GTT	2	6	153557	153562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_007613	TTATC	2	10	153625	153634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
422	NC_007613	TAA	2	6	153639	153644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_007613	GCT	2	6	160995	161000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_007613	ATT	3	9	162588	162596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_007613	TCT	2	6	163021	163026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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451	NC_007613	GCG	2	6	176734	176739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_007613	TTG	2	6	178673	178678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_007613	TG	4	8	178840	178847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
462	NC_007613	GTCTG	2	10	178851	178860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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471	NC_007613	GAA	2	6	183927	183932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_007613	AGG	2	6	195684	195689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_007613	T	6	6	196201	196206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_007613	CGG	2	6	196207	196212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_007613	CG	3	6	196306	196311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
491	NC_007613	CGC	2	6	196384	196389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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